Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms