Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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