Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms