Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms