Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms