Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms