Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX1P78414 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms