Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms