Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms