Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC11A2P49281 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms