Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD4P46934 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms