Protein–RNA interactions for Protein: P46531

NOTCH1, Neurogenic locus notch homolog protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH1P46531 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NOTCH1P46531 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NOTCH1P46531 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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