Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms