Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms