Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFNP31947 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFNP31947 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFNP31947 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFNP31947 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms