Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms