Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms