Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms