Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-EP13747 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-EP13747 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms