Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGTAO43765 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGTAO43765 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGTAO43765 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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