Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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