Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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