Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9Y3F1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms