Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms