Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms