Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCF2Q9UG63 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms