Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms