Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms