Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms