Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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