Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIM5Q9C035 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TRIM5Q9C035 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM5Q9C035 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM5Q9C035 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM5Q9C035 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM5Q9C035 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM5Q9C035 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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