Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF17Q9BXT8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms