Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL2Q99962 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms