Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NOTCH4Q99466 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NOTCH4Q99466 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NOTCH4Q99466 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NOTCH4Q99466 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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