Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP89Q96ST8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP89Q96ST8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms