Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG2BQ96BY7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG2BQ96BY7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms