Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG4Q92954 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms