Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms