Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD1Q8NHV4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms