Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms