Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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FAM46DQ8NEK8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM46DQ8NEK8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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