Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS8Q8N3P4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS8Q8N3P4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms