Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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