Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms