Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GREB1Q4ZG55 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms