Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDRF1Q3B7T1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms