Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms