Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms