Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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LAMA3Q16787 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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LAMA3Q16787 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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