Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms